DIEL 29, ÚTJefte 4 • DESIMBER 2025.
2025 Bewegelingsterminen Resinsjeartikel fan it jier
Undersyk nei neurodegenerative sykten mei help fan lange-lêssekwinsjearring en optyske genoommappingtechnologyen
Wy binne bliid dat wy de priis "Reviewartikel fan it Jier 2025" krigen hawwe fan 'e Bewegelingsterminen tydskrift. Nei it yntsjinjen by Bewegelingsterminen in artikel dat twa sibben beskriuwt mei in fenotype dat kompatibel is mei PRKN-assosjeare Parkinson's sykte (PD) oplost troch long-read sequencing (LRS), hat de haadredakteur ús freonlik útnoege om in resinsje te skriuwen dy't rjochte is op opkommende technologyen foar in net-genetysk publyk.
Wy leauden dat dizze resinsje op it goede momint kaam om twa redenen. Earst brûkten mear minsken LRS yn 'e kontekst fan neurodegenerative sykten, en in groeiende hoemannichte bewiis út 'e literatuer bewiisde syn fermogen om gefallen op te lossen dy't net ferklearre wurde troch koarte-lêzingssekwinsje fan it heule eksoom of it heule genoom. Twad, de meast resinte resinsje wie yn 2021 publisearre troch Su et al. yn Neurology, dêrom like in update needsaaklik. Wy wiene bliid om it skriuwen te akseptearjen, en woene in breed perspektyf biede op 'e resinte prestaasjes fan sawol LRS as optyske genoommapping (OGM), lykas har beheiningen, útdagings en kânsen foar de takomst.
Der binne trije haadtypen genetyske fariaasjes dy't ynfloed hawwe op minsklike eigenskippen: lytse farianten (farianten mei minder as 50 basispearen, ek wol single nucleotide farianten en ynfoegings/deleasjes neamd), koarte tandemherhellings (ek wol bekend as werhelle útwreidings RE's), en strukturele farianten (SV's, deleasjes, ynfoegings, duplikaasjes, ynversjes, translokaasjes). In protte wierskynlike monogene steurnissen hawwe noch gjin krekte molekulêre diagnoaze, benammen om't konvinsjonele sekwinsjemetoaden net effektyf binne yn it opspoaren fan SV's en RE's, dy't beide kausaal binne yn in protte neurogenetyske sykten. Dêrom binne ferskate inisjativen rjochte op it brûken fan LRS en/of OGM om de genetyske ûnderbou fan neurodegenerative sykten te ûntsiferjen. Wy hawwe ferskate wiidweidige foarbylden jûn yn 'e resinsje om de lêzer in begryp te jaan fan 'e prestaasjes fan LRS en OGM. Wy besprekke hoe't LRS ús mooglik makke om farianten te ûntdekken dy't net neamd wurde troch short-read sequencing yn bekende neurodegenerative sykten (bygelyks PRKN, SPG4) en nije kausale genen te ûntdekken (bygelyks Neuronale Intranukleêre ynklúzjesykte en NOTCH2NLC 5'UTR-útwreiding, Spinocerebellêre ataksie type 4 en ZFHX3). Wy yllustrearje ek it fermogen fan LRS om de grutte en it motief fan werhellingen te karakterisearjen, dy't ynfloed hawwe op 'e leeftyd fan oanset, penetrânsje, erflikens en klinyske fenotypen (CANVAS en RFC1, FXTAS en FMR1, SCA27B en FGF14). Wy beskriuwe ek de mooglikheid om farianten te fasearjen mei LRS en farianten yn genen te ûnderskieden fan dy yn har pseudogen (GBA1, SORD2), lykas de mooglikheid om nije transkripten te identifisearjen. Wy beklamje ek de foar- en neidielen fan optyske genoommapping by de identifikaasje fan SV's en RE's. Hoewol dizze technologyen foarearst meast brûkt wurde yn in ûndersyksomjouwing, ferwachtsje wy bredere ymplemintaasje yn klinyske laboratoaria yn 'e takomst. Wy hoopje dat dizze resinsje nuttich is foar professionals by it begripen fan har nut en beheiningen en by it ferstannich brûken fan har, sawol yn 'e kontekst fan diagnoaze as ûndersyk!
Harkje nei in podcast-ynterview oer dit artikel:
Harkje no
Lês mear Meigean: